Los núcleos aferentes (que son sensitivos y son derivados de la lámina alar) consisten en cuerpos de neuronas de proyección e interneuronas, sobre cuyos axones aferentes conectan con vías ascendentes o con vías de actividad refleja.
Pueden ser:
Aferentes somáticos generales (GSA): representados por el complejo componente sensorio del V, el cual está localizado bastante lateralmente al tronco encefálico.
Este complejo se divide en :
Núcleo espinal del V o núcleo del tracto trigémino, localizado en la médula oblongada, y está asociado con la sensación del dolor y temperatura de la mitad de la cara.
Núcleo pontino del V o núcleo sensorio principal, localizado en el puente, y está asociado con sensación de la presión y tacto de la cara y cavidad oral.
Núcleo mesencefálico del V: localizado en el cerebro medio y el cual recibe información de la propiocepción de la cara.
Aferentes viscerales generales (GVA): localizados laterales a la columna GVE y compuesto por un único núcleo denominado núcleo solitario o núcleo del tracto solitario, el cual está asociado con IX y X, recibiendo la sensación visceral de la faringe, laringe y porciones del esófago.
Aferente visceral especial (SVA):
Sistema formado por:
El componente del sentido del gusto del núcleo solitario, asociado con VII, IX y X, que recogen la sensación del gusto de la lengua y faringe.
El nervio I, que a pesar de no originarse en el tronco encéfalico, está dentro del SVA. El nervio olfatorio conduce la sensación de olfato directamente al lóbulo piriforme del telencéfalo.
Aferente somático especial (SSA): Formado por los siguientes núcleos del tronco encefálico:
El núcleo geniculado lateral, relacionado con la sensación de la visión, estando localizado en el tálamo y asociado con el nervio II.
El núcleo coclear, relacionado con la sensación de la audición, y el núcleo vestibular, relacionado con el sentido del equilibrio, ambos constituidos por columnas de neuronas localizadas en la médula oblongada y que forman el nervio VIII.